12只猴子第二季

十二猴军团追杀拉姆齐，岂料拉姆齐和科尔结盟反而干掉十二猴军团杀手，然而见证者的插手让科尔二人陷入危机跳桥逃生。凯西回到2043年，琼斯治好她的重伤。信使以瑞丽的性命要挟，琼斯用时空机器让六名信使重返过去。卡尔曼为拉姆齐摘除跟踪器，他想要趁机将拉姆齐出卖给十二猴军团。瑞丽利诱迪肯达成合作，打败信使救出琼斯。詹妮弗带着病毒出现在单身派对上，她要求相亲对象杀死她拯救世界。

瑞丽穿越而来奉命杀死詹妮弗，科尔以真情打动詹妮弗交出病毒。科尔销毁所有病毒，未来世界随之发生改变。科尔拒绝杀死詹妮弗，瑞丽带着拉姆齐返回未来。新未来仍旧存在灭世病毒，琼斯认为信使穿越过去制造瘟疫。2016年科尔和詹妮弗入住艾默生酒店，却得知他在1944年买下酒店的房间。詹妮弗受到精神操控，她似乎可以预知科尔的未来。拉姆齐知晓儿子依然存在，琼斯被女儿军团绑架。

信徒返回1944年酝酿阴谋，他们奉命刺杀克劳福德教授，瑞丽随即陪伴科尔返回这一年去阻止刺杀行动。科尔携瑞丽参加大学宴会，却没能及时阻止信使施展美人计暗杀克劳福德。科尔意外发现死者并非真的克劳福德教授，信使真正的目标是死者的儿子托米。托米拥有预言能力及时避开信使追杀，岂料信使绑架科尔，信使用托米的遗骨杀死托米，恐怖的红色森林由此在未来诞生。